Documents à envoyer


Pour chaque demande de séquençage, il faut impérativement nous envoyer par mail (PF-Seq-Gen@univ-nantes.fr) :

  • La fiche d'engagement (contactez la plateforme)
    (Uniquement pour le 1er envoi d'échantillons)


Vos échantillons

  • Formats des échantillons
EchantillonsQuantité
Vous envoyez au laboratoire:
Format d'expédition
Commentaires

Echantillons traités dans votre laboratoire

Par multiple de 48

Plaque 96 puits:

10 µl réactions de séquence purifiées

Plaque 384 puits :

5 µl réactions de séquence purifiée

Plaques 96 et 384 puits: Applied Biosystems MicroAmp TM optical


La Formamide utilisée doit impérativement être de qualité Hi-Di















  • Dyes utilisés sur la Plate-forme
filtreF(DS-32), 5-Fam. JOE. NED.ROX
filtreD(DS-30), 6-FAM.HEX.NED.ROX
filtreE(DS-02),dR110.dR6G.dTAMRA.dROX.LIZ
filtreG5(DS-33), 6-FAM.VIC.NED.PET.LIZ

Tous les puits de la plaque doivent  contenir une solution avant injection capillaire. Les puits vides sont à remplir avec de l'eau.

Pour la réalisation de votre première feuille de route de génotypage veuillez contacter le personnel de la plate-forme.

Envoi de vos échantillons

Quelques règles à respecter pour répartir vos échantillons en barrettes ou en plaques :

  • Identification

-Plaques:

Les plaques 96 puits doivent être identifiées de la manière suivante:
[nom du client]_[initiale du prénom]_[date de dépôt]_[n° de plaque]

Exemple:
plaque n°1: Gros_F_240311_1
plaque n°2: Gros_F_240311_2

  • Réceptions des échantillons

1. Echantillons déposés au laboratoire, au 2ème étage de l'IRS-UN pièce 222  ( aux horaires d'ouverture de l'IRT-UN )

En cas d'absence, déposer vos échantillons dans le congélateur pièce 224 (Tiroir identifié « RECEPTION DES ECHANTILLONS - Plateforme génomique »).

Les plaques doivent être clairement identifiées et fermées par un film adhésif pelable ou des bouchons.


2. Echantillons envoyés par courrier, à température ambiante et sous enveloppe à bulles à l'adresse de la Plate-forme.

Assurez-vous que vos échantillons soient correctement identifiés et fermées (par un film adhésif pelable ou des bouchons) et qu'ils n'arriveront pas le week-end ou un jour férié.


Plateforme Génomique de Nantes

IRS-UN 

Françoise Gros
Bureau 222
8 quai Moncousu
BP 70721
44007 NANTES Cedex 1